За более чем 60-летнюю историю в НИИ проблем биологической безопасности КН МОН РК накоплен огромный опыт работы в области биологической безопасности, биотехнологии, вирусологии, микробиологии, иммунологии. Учеными института разработано и внедрено более 60 наименований препаратов, в том числе 30 вакцин, 16 тест-систем и более 15 различных биопрепаратов.
За последние 10 лет институтом созданы технологии изготовления отечественных вакцин по особо опасным инфекциям.
Казахстан стал 7-ым государством мира, разработавшим вакцину против высокопатогенного гриппа птиц для здравоохранения, которая прошла клинические испытания в лаборатории ВОЗ. Также учёные института одними из первых в мире разработали вакцину против высокопатогенного свиного гриппа для здравоохранения.
В 2020 году учеными НИИПББ в кратчайший срок (2,5 месяца) в ускоренном режиме была разработана вакцина против оспы верблюдов.
В мае 2020 года институтом была разработана отечественная вакцина против коронавирусной инфекции QazCovid-in, которая сейчас проходит III завершающую фазу клинических испытаний.